Protein–RNA interactions for Protein: P00687

Amy1, Alpha-amylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amy1P00687 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amy1P00687 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amy1P00687 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Amy1P00687 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amy1P00687 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amy1P00687 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amy1P00687 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amy1P00687 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms