Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd7O88665 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd7O88665 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd7O88665 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd7O88665 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms