Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChkbO55229 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChkbO55229 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ChkbO55229 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChkbO55229 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChkbO55229 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChkbO55229 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChkbO55229 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ChkbO55229 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChkbO55229 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChkbO55229 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChkbO55229 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms