Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cyp26a1O55127 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms