Protein–RNA interactions for Protein: O55042

Snca, Alpha-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaO55042 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaO55042 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaO55042 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaO55042 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaO55042 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaO55042 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaO55042 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaO55042 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaO55042 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaO55042 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaO55042 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaO55042 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaO55042 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaO55042 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaO55042 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaO55042 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaO55042 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaO55042 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaO55042 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaO55042 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaO55042 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaO55042 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaO55042 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaO55042 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaO55042 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaO55042 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaO55042 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaO55042 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaO55042 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaO55042 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaO55042 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaO55042 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaO55042 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaO55042 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaO55042 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaO55042 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaO55042 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaO55042 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaO55042 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaO55042 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaO55042 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaO55042 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SncaO55042 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SncaO55042 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SncaO55042 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaO55042 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaO55042 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaO55042 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaO55042 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaO55042 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaO55042 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaO55042 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaO55042 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaO55042 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaO55042 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaO55042 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaO55042 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaO55042 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaO55042 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaO55042 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaO55042 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaO55042 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaO55042 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaO55042 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaO55042 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaO55042 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaO55042 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaO55042 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaO55042 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaO55042 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaO55042 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaO55042 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaO55042 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaO55042 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaO55042 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SncaO55042 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SncaO55042 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SncaO55042 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SncaO55042 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SncaO55042 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SncaO55042 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SncaO55042 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SncaO55042 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms