Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms