Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a2O54833 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms