Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms