Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FxnO35943 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FxnO35943 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FxnO35943 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FxnO35943 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FxnO35943 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FxnO35943 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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FxnO35943 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FxnO35943 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FxnO35943 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FxnO35943 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FxnO35943 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FxnO35943 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FxnO35943 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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FxnO35943 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FxnO35943 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FxnO35943 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FxnO35943 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FxnO35943 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FxnO35943 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FxnO35943 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FxnO35943 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FxnO35943 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FxnO35943 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FxnO35943 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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FxnO35943 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FxnO35943 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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FxnO35943 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FxnO35943 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FxnO35943 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FxnO35943 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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FxnO35943 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FxnO35943 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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FxnO35943 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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FxnO35943 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FxnO35943 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FxnO35943 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FxnO35943 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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FxnO35943 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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FxnO35943 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FxnO35943 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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FxnO35943 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FxnO35943 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FxnO35943 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FxnO35943 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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FxnO35943 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FxnO35943 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FxnO35943 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FxnO35943 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FxnO35943 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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FxnO35943 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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FxnO35943 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FxnO35943 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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