Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NudcO35685 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NudcO35685 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NudcO35685 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NudcO35685 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NudcO35685 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NudcO35685 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NudcO35685 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NudcO35685 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NudcO35685 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NudcO35685 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NudcO35685 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NudcO35685 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NudcO35685 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NudcO35685 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NudcO35685 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NudcO35685 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NudcO35685 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NudcO35685 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NudcO35685 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NudcO35685 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NudcO35685 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NudcO35685 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NudcO35685 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NudcO35685 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NudcO35685 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NudcO35685 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NudcO35685 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NudcO35685 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NudcO35685 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NudcO35685 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NudcO35685 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NudcO35685 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NudcO35685 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NudcO35685 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NudcO35685 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NudcO35685 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NudcO35685 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NudcO35685 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NudcO35685 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NudcO35685 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NudcO35685 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NudcO35685 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NudcO35685 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NudcO35685 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NudcO35685 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NudcO35685 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NudcO35685 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NudcO35685 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NudcO35685 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NudcO35685 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NudcO35685 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NudcO35685 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NudcO35685 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NudcO35685 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NudcO35685 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NudcO35685 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NudcO35685 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NudcO35685 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NudcO35685 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NudcO35685 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NudcO35685 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NudcO35685 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NudcO35685 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NudcO35685 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NudcO35685 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NudcO35685 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NudcO35685 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NudcO35685 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NudcO35685 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NudcO35685 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NudcO35685 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NudcO35685 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NudcO35685 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NudcO35685 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NudcO35685 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NudcO35685 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NudcO35685 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NudcO35685 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NudcO35685 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NudcO35685 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NudcO35685 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NudcO35685 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NudcO35685 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NudcO35685 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NudcO35685 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NudcO35685 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NudcO35685 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NudcO35685 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NudcO35685 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NudcO35685 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NudcO35685 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NudcO35685 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NudcO35685 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NudcO35685 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NudcO35685 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NudcO35685 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NudcO35685 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NudcO35685 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NudcO35685 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms