Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema6aO35464 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms