Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Prrt1O35449 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Prrt1O35449 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Prrt1O35449 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prrt1O35449 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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