Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna4O35343 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms