Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcns1O35173 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Kcns1O35173 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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