Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Kcnk3O35111 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Kcnk3O35111 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kcnk3O35111 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnk3O35111 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kcnk3O35111 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Kcnk3O35111 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnk3O35111 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Kcnk3O35111 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Kcnk3O35111 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk3O35111 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk3O35111 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk3O35111 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk3O35111 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Kcnk3O35111 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk3O35111 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk3O35111 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnk3O35111 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk3O35111 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk3O35111 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk3O35111 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk3O35111 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk3O35111 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk3O35111 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnk3O35111 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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