Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn4O35054 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Cldn4O35054 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Cldn4O35054 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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