Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP290O15078 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP290O15078 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP290O15078 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP290O15078 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP290O15078 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP290O15078 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP290O15078 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP290O15078 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP290O15078 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP290O15078 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP290O15078 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP290O15078 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP290O15078 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP290O15078 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP290O15078 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP290O15078 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP290O15078 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP290O15078 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP290O15078 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP290O15078 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP290O15078 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP290O15078 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP290O15078 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP290O15078 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP290O15078 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP290O15078 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP290O15078 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP290O15078 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP290O15078 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP290O15078 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP290O15078 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP290O15078 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP290O15078 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP290O15078 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP290O15078 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP290O15078 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP290O15078 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP290O15078 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP290O15078 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP290O15078 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP290O15078 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP290O15078 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP290O15078 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP290O15078 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP290O15078 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP290O15078 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP290O15078 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP290O15078 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP290O15078 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP290O15078 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP290O15078 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP290O15078 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP290O15078 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP290O15078 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP290O15078 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP290O15078 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP290O15078 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP290O15078 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP290O15078 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP290O15078 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP290O15078 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP290O15078 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP290O15078 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP290O15078 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP290O15078 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP290O15078 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP290O15078 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP290O15078 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP290O15078 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP290O15078 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP290O15078 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP290O15078 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP290O15078 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP290O15078 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP290O15078 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP290O15078 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP290O15078 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP290O15078 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP290O15078 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP290O15078 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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