Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nfil3O08750 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms