Protein–RNA interactions for Protein: O08644

Ephb6, Ephrin type-B receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb6O08644 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb6O08644 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ephb6O08644 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms