Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ascl4M0QW46 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms