Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Gm379J3QQ19 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Gm379J3QQ19 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Gm379J3QQ19 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Gm379J3QQ19 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Gm379J3QQ19 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Gm379J3QQ19 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm379J3QQ19 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm379J3QQ19 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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