Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccer2J3QPU5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccer2J3QPU5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms