Protein–RNA interactions for Protein: J3QN86

Gm21882, Predicted gene, 21882, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21882J3QN86 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21882J3QN86 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21882J3QN86 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21882J3QN86 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21882J3QN86 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21882J3QN86 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21882J3QN86 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21882J3QN86 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21882J3QN86 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21882J3QN86 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21882J3QN86 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21882J3QN86 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21882J3QN86 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms