Protein–RNA interactions for Protein: J3QMW9

Btbd35f6, BTB domain-containing 35, family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f6J3QMW9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Btbd35f6J3QMW9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms