Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21818J3KMS6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms