Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf4bG5E8Z2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms