Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms