Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933406M09RikG3XA12 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms