Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmgxb3G3X9M3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms