Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ercc6F8VPZ5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ercc6F8VPZ5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms