Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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H2-M1F7CXU4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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H2-M1F7CXU4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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H2-M1F7CXU4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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H2-M1F7CXU4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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H2-M1F7CXU4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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H2-M1F7CXU4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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H2-M1F7CXU4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms