Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28038F7BCN9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms