Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm20538F6Z9R1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms