Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21977F6U3N7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21977F6U3N7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21977F6U3N7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21977F6U3N7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21977F6U3N7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21977F6U3N7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms