Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9N3

Vmn1r152, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r152E9Q9N3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r152E9Q9N3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms