Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga10E9Q6R1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga10E9Q6R1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms