Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms