Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl3E0CZ16 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms