Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ptprz1B9EKR1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprz1B9EKR1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms