Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CatipB9EKE5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CatipB9EKE5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms