Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms