Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cped1B2RX70 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms