Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms