Protein–RNA interactions for Protein: A7UAK5

Pfkfb3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-biphosphatase 3 splice variant 2, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfkfb3A7UAK5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfkfb3A7UAK5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfkfb3A7UAK5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms