Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms