Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbf1A2A870 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbf1A2A870 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fbf1A2A870 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fbf1A2A870 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fbf1A2A870 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbf1A2A870 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fbf1A2A870 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fbf1A2A870 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fbf1A2A870 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fbf1A2A870 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbf1A2A870 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbf1A2A870 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbf1A2A870 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbf1A2A870 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbf1A2A870 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbf1A2A870 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbf1A2A870 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbf1A2A870 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbf1A2A870 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbf1A2A870 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbf1A2A870 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms