Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms