Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a4Q9Z306 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms