Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp5Q9Z2P8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms