Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Robo3Q9Z2I4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Robo3Q9Z2I4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Robo3Q9Z2I4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Robo3Q9Z2I4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Robo3Q9Z2I4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Robo3Q9Z2I4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Robo3Q9Z2I4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Robo3Q9Z2I4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Robo3Q9Z2I4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Robo3Q9Z2I4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Robo3Q9Z2I4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Robo3Q9Z2I4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Robo3Q9Z2I4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Robo3Q9Z2I4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Robo3Q9Z2I4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Robo3Q9Z2I4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Robo3Q9Z2I4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Robo3Q9Z2I4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Robo3Q9Z2I4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Robo3Q9Z2I4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Robo3Q9Z2I4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Robo3Q9Z2I4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Robo3Q9Z2I4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms